Added submit_01b_array.sh

submit_01b_array.sh

+#!/bin/bash
+
+#$ -S /bin/bash
+#$ -N HIDDENcov-pa
+
+#$ -o /work/$USER/$JOB_NAME-$JOB_ID-$TASK_ID.log
+#$ -j y
+
+#$ -l h_rt=00:30:00:00
+#$ -l h_vmem=2G
+
+#$ -pe smp 1-1
+
+#$ -cwd
+
+#$ -t 1-1
+
+module load GCC/8.3.0
+module load OpenMPI/3.1.4
+module load R/3.6.2
+
+output=/data/splot/HIDDEN/output/HIDDENcov
+
+Rscript \
+    cli_01b.r \
+    --max.inter.t 1 \
+    --chunk.i $SGE_TASK_ID \
+    --chunkn 50 \
+    --nperm 99 \
+    --ncores ${NSLOTS:-1} \
+    --start.round 1 \
+    --relax.round 1 \
+    /data/splot/HIDDEN/species.out.10perc.cov.txt \
+    /data/splot/HIDDEN/traits.out.10perc.cov.txt \
+    "$output" \
+    "get.corXY.bootstrap" \
+    "all" \
+